Ezzel a progival sikerült megcsinálnom.

Bemásolod a SignApk könyvtárba az az apk-t amit csináltál.

parancssorban belépsz a mappába és beírod ezt:

java -jar signapk.jar certificate.pem key.pk8 amit_módosítottál.apk ami_signalva lesz.apk

VAGY

java -jar signapk.jar certificate.pem key.pk8 amit_módosítottal.zip ami_signalva_lesz_rom.zip