"még nem találtam automatikus időszinkron beállítási módot..."
erret tipp: a hálózat lassabban áll fel, mint ahogy a boot folyamat végetér. A systemd -re váltás sokat gyorsított a boot időn, de van ilyen mellékhatása, ha nincs rendesen felkészítve erre a rendszer vagy bugos valamelyik szolgáltatás.
De persze az is lehet, hogy alapból nincs fenn a szolgáltatás
apt-get install ntp
Ha a boot kapcsán van probléma, akkor elvileg meg lehet adni valahogy, hogy az ntpd várja meg a hálózat felállását.