A két ciklus közé kellett ez a pár sor, és most úgy működik, ahogy szeretném.
        # Ha a ch1 piros, kikapcsolja a ch1 zöldet
        if 14 in powered_pins and 16 in powered_pins:
           powered_pins.remove(16)
        # Ha a ch2 piros, kikapcsolja a ch2 zöldet
        if  4 in powered_pins and 26 in powered_pins:
           powered_pins.remove(26)
        # Ha a ch3 piros, kikapcsolja a ch3 zöldet
        if  3 in powered_pins and 20 in powered_pins:
           powered_pins.remove(20)
        # Ha a ch4 piros, kikapcsolja a ch4 zöldet
        if  2 in powered_pins and 21 in powered_pins:
           powered_pins.remove(21)

Köszönöm a segítséget, útba igazítást!