Én arra tippelnék, hogy kijárna egy tisztességes formázás a flash memóriának.

Viszont mihez kell a root? Az AOSP 4.4.4 ROM már előre rootolva van, így erre utána nem lesz szükség és a flashelés során amúgy is elveszne a régi ROM-on megszerzett root jog.

Ha a régi ROM-on akarsz elérni mentés céljával olyan dolgokat, amikhez root kell, akkor javaslom a telefon eredeti topikját, hátha mások találkoztak már ilyen hibával.