Úgy látszik hogy meglett a hiba. A transmission tökéletesen működik, míg az alapértelmezett letöltési könyvtárba tölt. Amint átállítom a letöltés helyét egy másik mappába, azonnal felugrik a cpu-terhelés 100%-ra, a hdd-k folyamatosan kattognak és egy idő után elérhetetlen lesz a NAS.
A mappa jogosultságaival volt a probléma, a webes admin felületen létrehozott megosztásokba nincs joga írni a transmission-nak. Ezt javítva tökéletesen működik.