"Annyit állítottam csupán, hogy ami a mindenkori tudásszinten nem volt magyarázható, aköré (is) épült a hit. Meg az értékrend köré."

Nem!
Az értékrend a hit köré épült és épül. Ennek a jelentőségével bizonyosan tisztában vagy.

" bizonyos képességek, pl. az öngyógyulás."

Az öngyógyulás teljesen természetes jelenség. Minden influenza,... esetében bekövetkezik. Sőt minden más betegség esetében, amire csak tüneti kezelés létezik és nem halnak bele az emberek. az öngyógyulásnak is vannak határai. Az elvesztett végtag az ember esetében nem nő ki magától. Csodaban lehetséges, leginkább a mesék szintjén.

"Szerintem a hit akkor lenne kizárólagos magyarázat jelenségekre (csodákra), ha "törés" lenne a valóságban, vagy másként mondva egy szimulált világban élnénk."

Értem, tehát a piros szemű elefánt a cseresznyefán csak a szimulált valóságban látható.
De ez nem jelenti azt, hogy a mi valóságunkban elefánt képes fára mászni.
A nemlétező csodákra természetesen nincs magyarázata a tudománynak.
Amúgy szép próbálkozás, sokan bedőlnek neki.

" Ezt nincs okom feltételezni, bár kétségkívül a Biblia ilyesmit állít, vagy legalábbis beleérthető, hiszen a csodák mechanizmusát nem fejtegeti.
De ugyanakkor kizárni sem tudom."

Már bocsánat, de most erősíted meg, hogy elefántot a cseresznyefán még senki sem látott.
Persze valami csoda folytán valaki láthatott.
Értem én, hogy nem a bibliától függ a csodák mechanizmusa. A nem létező csodák, nem létező mechanizmusa valóban nem függhet a csodától.
Vagy te ezt másképpen gondolod?
Áá, ez költői kérdés, saját magaddal nem fogsz vitába keveredni.